Un nuevo m\u00e9todo permite vincular la gen\u00e9tica y la funci\u00f3n de microbios individuales que viven sin ox\u00edgeno en las profundidades de la Tierra.
\nMedir ambos atributos (y, lo que es m\u00e1s importante, vincularlos) fue durante mucho tiempo un desaf\u00edo en microbiolog\u00eda, pero es fundamental para comprender el papel de las comunidades microbianas en procesos globales como el ciclo del carbono.
\nLos hallazgos, publicados en \u2018Proceedings of the National Academy of Sciences\u2019 por un equipo de cient\u00edficos dirigido por investigadores del Laboratorio Bigelow de Ciencias Oce\u00e1nicas, muestran c\u00f3mo este m\u00e9todo puede ser una herramienta poderosa para medir la actividad de diferentes organismos en estos ambientes extremos.
\nEl nuevo enfoque, desarrollado en el Centro de Gen\u00f3mica Unicelular del Laboratorio Bigelow (SCGC por sus siglas en ingl\u00e9s), permiti\u00f3 a los investigadores descubrir que una especie de bacteria consumidora de sulfato era no s\u00f3lo el organismo m\u00e1s abundante sino tambi\u00e9n el m\u00e1s activo en un acu\u00edfero de agua subterr\u00e1nea del Valle de la Muerte (California), a cientos de metros bajo la superficie.
\n\u201cAnteriormente, ten\u00edamos que asumir que todas las c\u00e9lulas operaban al mismo ritmo, pero ahora podemos ver que existe una amplia gama de niveles de actividad entre los miembros individuales de las comunidades microbianas\u201d, explica la investigadora cient\u00edfica y autora principal del art\u00edculo Melody R. Lindsay, citada por Eureka Alert.
\nEl estudio reciente es parte de un proyecto m\u00e1s amplio que vincula el c\u00f3digo gen\u00e9tico de los microbios (el modelo de lo que son capaces de hacer) con lo que realmente est\u00e1n haciendo en un momento dado.
\nLa citometr\u00eda de flujo, un m\u00e9todo para analizar microbios ambientales individuales que fue adaptado en el Laboratorio Bigelow de las ciencias biom\u00e9dicas, permiti\u00f3 a los investigadores clasificar r\u00e1pidamente los microbios vivos en las muestras de agua del acu\u00edfero. Esos microbios se ti\u00f1eron con un compuesto especialmente dise\u00f1ado que se ilumina bajo el l\u00e1ser de citometr\u00eda de flujo cuando ocurren ciertas reacciones qu\u00edmicas dentro de la c\u00e9lula. La relaci\u00f3n entre la fluorescencia de las c\u00e9lulas bajo el l\u00e1ser y la velocidad de esas reacciones fue resuelta experimentalmente con cultivos de c\u00e9lulas cultivadas en laboratorio por estudiantes internos en el Laboratorio Bigelow y luego aplicada a las muestras del Valle de la Muerte.
\nUna vez que se midieron y aislaron las c\u00e9lulas activas, el equipo secuenci\u00f3 sus genomas individuales. Los investigadores tambi\u00e9n utilizaron metatranscript\u00f3mica, un m\u00e9todo para determinar qu\u00e9 genes se expresan activamente, y trazadores de radiois\u00f3topos, un m\u00e9todo m\u00e1s tradicional para medir la actividad dentro de una comunidad microbiana. Esto se hizo tanto para \u201cverificar dos veces\u201d sus resultados como para obtener a\u00fan m\u00e1s informaci\u00f3n sobre los v\u00ednculos entre lo que estos microbios son gen\u00e9ticamente capaces de hacer y lo que realmente est\u00e1n haciendo.
\nCon este nuevo estudio, el equipo est\u00e1 ampliando ese m\u00e9todo para demostrar que se puede utilizar en entornos de baja biomasa con microbios que no dependen del ox\u00edgeno. \u201cComenzamos con organismos que respiran ox\u00edgeno en el oc\u00e9ano porque son un poco m\u00e1s activos, un poco m\u00e1s f\u00e1ciles de clasificar y m\u00e1s f\u00e1ciles de cultivar en el laboratorio\u201d, relata Lindsay.
\nLos resultados confirmaron que la bacteria Candidatus Desulforudis audaxviator no s\u00f3lo era el microbio m\u00e1s abundante en este entorno, sino tambi\u00e9n el m\u00e1s activo, reduciendo el sulfato para obtener energ\u00eda. Las tasas de actividad general que midi\u00f3 el equipo fueron bajas en comparaci\u00f3n con las muestras de agua de mar del estudio anterior, pero hubo grandes diferencias entre la actividad de los microbios individuales. (Europa Press)<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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