Cient\u00edficos brasile\u00f1os crearon una herramienta computacional innovadora y \u00e1gil capaz de vincular y analizar distintas bases de datos de salud con millones de registros. Esta plataforma, llamada Tucuxi-BLAST, codifica los distintos registros existentes en un banco \u2013el nombre del individuo, el nombre de su madre y su ciudad de nacimiento, por ejemplo\u2013 mediante el empleo de letras representativas de los nucle\u00f3tidos de una secuencia de ADN (A, T, C o G). Y al \u201ctransformar\u201d a la persona en un ADN, permite que se interconecte la informaci\u00f3n presente en distintos bancos aun cuando contenga errores o inconsistencias.<\/p>\n
Estos resultados pueden aplicarse en investigaciones y an\u00e1lisis epidemiol\u00f3gicos, y en la formulaci\u00f3n de pol\u00edticas p\u00fablicas.<\/p>\n
Con este m\u00e9todo, es posible efectuar un cruzamiento de la base de personas vacunadas en el SUS (el Sistema \u00danico de Salud, la red nacional y p\u00fablica de salud de Brasil) con datos de otros bancos para hallar a los pacientes vacunados que contrajeron una determinada enfermedad, por ejemplo. Aun cuando esos registros contengan errores de tipeado, letras fuera de lugar o carezcan de alg\u00fan dato (un espacio inexistente o no completado), Tucuxi-BLAST puede identificar que se trata de los mismos individuos provenientes bases de datos distintas.<\/p>\n
Es decir, el sistema entiende las diferencias de registro de un mismo individuo como si fueran \u201cmutaciones\u201d en el ADN. Sucede que las herramientas gen\u00f3micas son capaces de mostrar los fragmentos m\u00e1s similares a otros y efectuar, de este modo, la conexi\u00f3n de las bases. Con la secuencia de letras para cada individuo, es posible cruzar y unir datos de distintos repositorios.<\/p>\n
\u201cEl SUS puede constituir una fuente preciosa de informaci\u00f3n para la concreci\u00f3n de estudios m\u00e9dicos y epidemiol\u00f3gicos, ya que almacena datos de salud de millones de individuos. Con todo, cada enfermedad o cada tipo de dato queda almacenado en bases distintas, que no siempre conversan entre s\u00ed. Con el m\u00e9todo que desarrollamos, que es eficaz y r\u00e1pido, es posible efectuar el enlace entre ellas\u201d, afirma Helder Nakaya, autor corresponsal de art\u00edculo publicado en la revista cient\u00edfica PeerJ, en entrevista concedida a Agencia FAPESP. Nakaya es un inmun\u00f3logo vinculado a la Facultad de Ciencias Farmac\u00e9uticas de la Universidad de Sao Paulo (FCF-USP).<\/p>\n
Aparte de desarrollar investigaciones en el Hospital Israelita Albert Einstein, en la Plataforma Cient\u00edfica Pasteur-USP (SPPU) y en el Instituto Todos pela Sa\u00fade, Nakaya forma parte del Centro de Investigaciones en Enfermedades Inflamatorias (CRID), un Centro de Investigaci\u00f3n, Innovaci\u00f3n y Difusi\u00f3n (CEPID) de la FAPESP\u2026<\/p>\n
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LA PUESTA EN PR\u00c1CTICA<\/strong><\/p>\n Antes incluso de que el art\u00edculo se publicase, la herramienta empez\u00f3 a utilizarse en la pr\u00e1ctica. Tucuxi-BLAST fue el instrumento de otra investigaci\u00f3n que combin\u00f3 un conjunto de datos del Sistema de Vigilancia de la Malaria (Sivep malaria) del Ministerio de Salud de Brasil con informaci\u00f3n cl\u00ednica del sistema hom\u00f3logo de la Fundaci\u00f3n de Medicina Tropical Dr. Heitor Vieira Dourado \u2013 filial Manaos (en la Amazonia brasile\u00f1a) de la Fundaci\u00f3n Oswaldo Cruz (Fiocruz), brazo de investigaci\u00f3n del Ministerio de Salud. Este cruzamiento abarca un per\u00edodo de cuatros a\u00f1os.<\/p>\n El resultado de este trabajo mostr\u00f3 que el hecho de ser VIH positivo se erige como un riesgo en casos de infecci\u00f3n por malaria causada por Plasmodium vivax, lo que constituye un desaf\u00edo extra en la formulaci\u00f3n de pol\u00edticas p\u00fablicas orientadas a atender pacientes con la enfermedad transmitida por el mosquito Anopheles.<\/p>\n Con la ausencia de un identificador \u00fanico, Tucuxi-BLAST utiliz\u00f3 los nombres del paciente y de la madre y la fecha de nacimiento. Las conclusiones se publicaron en mayo en la revista Scientific Reports.<\/p>\n Coordinado por investigadores de la Universidad del Estado de Amazonas (UEA), este estudio cont\u00f3 con la participaci\u00f3n de Nakaya y del cient\u00edfico de datos Jos\u00e9 Deney Alves Ara\u00fajo, de la FCF-USP, primer autor del art\u00edculo publicado en PeerJ. Alves Ara\u00fajo fue quien le dio su nombre al sistema, bautizado Tucuxi en honor a una especie de cet\u00e1ceo de agua dulce hom\u00f3nima, de la familia de los delfines, existente en la cuenca del Amazonas.<\/p>\n En tanto, BLAST proviene del nombre de la herramienta b\u00e1sica de b\u00fasqueda de alineamiento local, muy utilizada en bioinform\u00e1tica para comparar grandes bancos de datos con secuencias biol\u00f3gicas.<\/p>\n <\/p>\n C\u00d3MO FUNCIONA<\/strong><\/p>\n Para desarrollar el nuevo m\u00e9todo, los cient\u00edficos tradujeron los datos de individuos en secuencias de ADN empleando una rueda de codones, una serie de bases nitrogenadas de ARN mensajero responsables de la codificaci\u00f3n de un determinado amino\u00e1cido o que indican el punto de comienzo o fin de la cadena de ARNm. Esas ruedas cambian en distintas ejecuciones sin perjudicar la eficiencia del proceso.<\/p>\n El esquema de codificaci\u00f3n permite la criptograf\u00eda de datos en tiempo real, lo que asegura la privacidad durante la vinculaci\u00f3n. \u201cTrabajando con ADN es posible encriptar los datos, con una seguridad mayor al respecto de la privacidad de la informaci\u00f3n\u201d, explica Nakaya.<\/p>\n La comparaci\u00f3n de los campos de identificaci\u00f3n codificados por ADN se efect\u00faa utilizando el BLAST y algoritmos de aprendizaje de la computadora, que autom\u00e1ticamente clasifican los resultados finales.<\/p>\n Similar a la gen\u00f3mica comparativa, en la cual se comparan genes de distintos genomas para determinar secuencias comunes y \u00fanicas, Tucuxi-BLAST hace posible la integraci\u00f3n simult\u00e1nea de m\u00faltiplos bancos administrativos, sin necesidad de datos complejos procesados previamente.<\/p>\n Durante el estudio, el grupo teste\u00f3 y compar\u00f3 informaci\u00f3n de un banco simulado con registros de 300 millones de individuos, aparte de cuatro grandes bases de datos administrativos con informaci\u00f3n real de pacientes brasile\u00f1os.<\/p>\n La conclusi\u00f3n indic\u00f3 que el m\u00e9todo logr\u00f3 superar errores ortogr\u00e1ficos y tipogr\u00e1ficos en un lapso de tiempo cinco veces m\u00e1s r\u00e1pido: mientras que el procesamiento en enlaces de registros (RL, las siglas en ingl\u00e9s para record linkage) del mayor conjunto de datos (200 mil registros) tard\u00f3 127 horas (cinco d\u00edas y siete horas), Tucuxi-BLAST lo hizo en 23 horas (menos de un d\u00eda).<\/p>\n Los investigadores crearon un sitio web donde es posible \u201ctraducir\u201d palabras, frases y nombre en ADN.<\/p>\n Nakaya recuerda que algunos pa\u00edses, tales como Inglaterra, Canad\u00e1 y Australia, invirtieron en iniciativas exitosas de an\u00e1lisis de datos, construyendo centros para la integraci\u00f3n y el desarrollo de nuevas estrategias de an\u00e1lisis.<\/p>\n En Brasil, un ejemplo de ello es el Centro de Integraci\u00f3n de Datos y Conocimientos en Salud (Cidacs\/Fiocruz), que dispone de un banco con informaci\u00f3n de 114 millones de brasile\u00f1os, obtenida mediante la integraci\u00f3n de bases administrativas y de salud\u2026 (Agencia FAPESP).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cient\u00edficos brasile\u00f1os crearon una herramienta computacional innovadora y \u00e1gil capaz de vincular y analizar distintas bases de datos de salud con millones de registros. 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